МОЖЕТ ЛИ БЫТЬ ЛОЖНО-ОТРИЦАТЕЛЬНЫЙ РЕЗУЛЬТАТ?

Александр, судя по всему, Вы много читаете о ВИЧ-инфекции. В таком случае Вы должны знать, что у ВИЧ нет специфических симптомов, т.е. таких, которые однозначно говорили бы о присутствии в организме именно этого вируса. Это во-первых, а во-вторых, "обнаружить что-то похожее" можно практически все, что угодно, если хорошо поискать и присмотреться.
Ложноотрицательные результаты действительно бывают, но для Вашего случая это не актуально. Если потенциально опасный контакт был у Вас 3 года назад, а анализ Вы сдали в этом году, значит, его результатам можно верить.